跟骨骨刺引起行走疼痛的基本原因是骨刺对足部软组织长期慢性刺激，使受刺激的局部产生慢性无菌性炎症，无菌性炎症及其代谢产物刺激了足部组织的神经末梢，从而出现疼痛及不适感。如人在行走时，骨刺必然与周围肌肉、腱膜等软组织产生摩擦等，造成不同程度的组织损伤。这些损伤包括局部出血、水肿、渗出、组织的纤维化、炎性细胞(如淋巴细胞)浸润、代谢产物在局部组织中堆积等，这些损伤及反应都会刺激感觉神经，使人有疼痛感。

　　此外，行走时骨刺对足底部皮肤和软组织的压迫以及跟骨内血液淤积及压力增高等也是产生疼痛的原因之一。