美国国立糖尿病、消化道及肾脏疾病研究所胡夫纳格尔（Hoofnagle）教授在《慢性病毒性肝炎治疗》的演讲中，展望了未来慢性乙肝的治疗方向。他认为，应用核苷类似物长期治疗直至HBsAg检测不到可能会成为理想的治疗策略；要达到长期持续有效抑制HBV DNA的目的，必须避免发生病毒耐药或一旦发生耐药须及早干预；新型核苷类似物（恩替卡韦和TDF）耐药率更低，抗病毒作用更强，但其长期疗效和安全性尚不清楚。
　　聚乙二醇干扰素联合利巴韦林仍是迄今慢性丙肝的最佳治疗手段。Hoofnagle指出，达到持续病毒学应答（SVR）意味着血清ALT和组织学改善，肝脏纤维化进展停止，肝癌危险极低，目前治疗手段的SVR率只有50％。
　　2005年的一项研究表明，应答者与无应答者之间有18个基因表达差异显著。无应答者可能已存在干扰素刺激基因（ISG），聚乙二醇干扰素不能进一步增加ISG活性，此外，病毒还可能抑制干扰素活性。
　　如何突破治疗瓶颈？一方面，一系列蛋白酶抑制剂和聚合酶抑制剂相继问世，这些新药联合聚乙二醇干扰素和利巴韦林，SVR率有所提高；另一方面，老药如水飞蓟宾、硝唑尼特、S－腺蛋氨酸既可用于无应答者的挽救治疗，也可与聚乙二醇干扰素和利巴韦林联用以提高SVR率。近期内，在聚乙二醇干扰素＋利巴韦林的基础上，加用某些蛋白酶抑制剂，可将SVR率提高到75％。