肛周脓肿的手术方法：①如果是肛周脓肿早期，脓肿还是一个炎性包块，尚未成脓，可以抗感染治疗、中药外敷等；②如果已经成脓，脓肿范围较小、位置较浅，可以采取肛周脓肿一期根治手术，但手术的关键和难点是准确寻找并正确处理原发感染病灶――脓肿内口；③如果已经成脓，脓肿范围较大、位置较深，最好先行肛周脓肿切排术，待肛瘘形成后进一步处理原发感染病灶――内口，有利于保护肛门的形态和功能：④如果已经成脓，并已经自行破溃流脓，只需先行肛周脓肿扩创引流，待肛瘘形成后进一步处理原发感染病灶――内口；⑤如果是特异性感染或疾病形成肛周脓肿，还需治疗特异性感染或疾病，如结核杆菌感染或炎症性肠病、糖尿病等等。
　　如果手术治疗，尽量采用微创微痛的治疗方法，其具有创伤小、安全性高、痛苦小，恢复快的优点。