消化系统的发育在胎儿时期就已经很完备了，此时，胎儿已经可以通过吞吐母亲的羊水来摄取一些营养物质，但还不具备正常的消化功能，出生后这种能力逐渐发育并迅速完善。新生儿和婴儿的消化吸收能力是随着母乳喂养儿迅速发展。研究显示，母乳喂养的婴儿在出生后数周已能吸收80％~90％的脂肪、蛋白和糖。但是，用牛乳喂养的婴儿，在出生后4~5个月，对牛乳中脂肪的消化吸收仍很差。新生儿的肠管通透性强，发育到4~5岁时，才可以说接近成熟。从这个发育过程我们可以了解到，发生食物性变态反应的可能性在婴幼儿时期就已经开始，在这一时期发生食物性变态反应的也屡见不鲜。特别是新生儿时期的肠道通透性强，所以在这一时期喂给婴儿的牛奶中的蛋白质虽未充分消化也能被吸收，从而容易引起变态反应。这也可以解释食物性变态反应为什么在婴儿期之前较多。